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肠道菌群检测16sRNA(16srna和16sdna一样吗?)

来源:www.hn139.net   时间:2023-05-10 19:44   点击:137  编辑:admin   手机版

一、16srna和16sdna一样吗?

16Smα和16sdna不是一样的,这是因为这两个单项式所含的字母不同,16smα所含的字母是S、m、α三个字母。而16sdnα所含的字母是s、d、n、a,如果是找公因式的话,它们是共同的因式16sα,其余的是不一样的,所以它们两个是不能进行合并同类项计算的,

二、怎样检测某段序列是否是16srrna通用序列?

一句话:16S rRNA序列在进化上是保守的,通常用来鉴定细菌等原核生物,并可进行进化分析。 详细的:16s rRNA广泛存在于原核生物的细胞中,其分子长度约为1.5kb左右。 相比其他分子,16S rRNA既保证了较大的信息量(如5S rRNA太短, 包含信息量太少)又便于扩增和测序(23S rRNA较长,测序时比较麻烦)。事实上这三种编码原核生物核糖体RNA的rRNA基因序列在进化上都是保守的,都可以拿来进行进化分析,但基于上述原因一般都用16S rRNA序列。 鉴定细菌到种一般都采用16S rRNA和传统生化指标相结合的方法 附1: 首先如果你的菌株是自然界中分离得到,就只能鉴定到种,不能鉴定到株,因为多多少少和其他株系的细菌有区别,即便你做了一些特征的鉴定,发现和某一株细菌一模一样,你也没有理由说你的细菌就是那一株细菌,因为你不可能把所有的特征都做完,株和株之间的关系就相当于不同的人之间的关系,世界上不可能有完全相同的两个人。除非你知道你的细菌本来就是某一株细菌扩增出来的(而且要保证没有变异,否则就是一个新株),可是这样就没必要鉴定了。 菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16srDNA片段,上GeneBank或者Eztaxon对比即可。 一般序列相似度在97%以上(也有说法是98%,甚至更高)就可以认为是同种细菌(当然也有例外,DNA序列仅仅是一个参考指标)。 附2:16S rRNA鉴定一般步骤: 一、提取其DNA,利用16SrRNA通用引物PCR扩增出其16SrRNA,取出一半进行跑胶测试纯度与大小,一般是1500bp左右,以下称之为目的基因 二、如果第一步得到的目的基因理想,就将目的基因连接到T载体上,T载体有很多种,随便哪种都可以,如果一种连接不上就换另一种,应该注意记得所用T载体的分子量大小,一般3000bp左右 三、连接后将整个连接体导入大肠杆菌细胞感受态细胞(很多实验书上都有具体步骤) 四、培养感受态细胞16或18小时,提取其质粒,然后将质粒拿出一部分跑胶,看提取情况并看一下分子量是否为16SrRNA和T载体的分子量之和,如果是,则成功 五、酶切所提取的质粒,以得到目的基因,跑胶,如果有目的基因大小的明亮条带则说明是16SrRNA,拿去测序就可以了

三、16srna测序是什么技术?

16S测序可以对微生物核糖体RNA的特定区域或全长序列进行扩增子测序,获得群落的物种组成结构,掌握群落多样性变化。

四、16s基因序列是什么?

16s rRNA

16S rRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中。

16S rRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长(包含约50个功能域)。随着PCR技术的出现及核酸研究技术的不断完善,16S rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具。数据库的不断完善,应用该技术可以实现对病原菌进行快速、微量、准确简便地分类鉴定和检测。该技术主要有三个步骤:首先是基因组DNA的获得,其次是16S rRNA基因片段的获得,最后是进行16S rRNA基因序列的分析。

核蛋白体RNA( ribosomal RNA, rRNA)是细胞内含量最多的RNA,约占RNA总量的80%。rRNA与核蛋白体蛋白(ribosomalprotein)共同构成核蛋白体(ribosome)。核蛋白体中的rRNA和核蛋白体蛋白共同为蛋白质生物合成所需要的mRNA、tRNA以及多种蛋白因子提供了相互结合和相互作用的空间环境。

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